Unit kerja di Dinas Perhubungan Kota Pasuruan meliputi beberapa unit, diantaranya :
- Sekretariat
- Bidang Lalu Lintas
- Bidang Angkutan
- Unit Pelaksana Teknis Penerangan Jalan Umum
- Unit Pelaksana Teknis Pengujian Kendaraan Bermotor
- Kelompok Jabatan Fungsional